Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXC5Q00444 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms