Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD3P84022 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD3P84022 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms