Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRB1P82279 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRB1P82279 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRB1P82279 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRB1P82279 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRB1P82279 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRB1P82279 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CRB1P82279 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRB1P82279 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRB1P82279 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRB1P82279 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRB1P82279 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRB1P82279 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRB1P82279 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRB1P82279 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRB1P82279 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRB1P82279 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CRB1P82279 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRB1P82279 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRB1P82279 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRB1P82279 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRB1P82279 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRB1P82279 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CRB1P82279 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRB1P82279 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRB1P82279 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRB1P82279 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRB1P82279 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRB1P82279 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRB1P82279 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRB1P82279 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CRB1P82279 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRB1P82279 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRB1P82279 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRB1P82279 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CRB1P82279 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CRB1P82279 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRB1P82279 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CRB1P82279 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRB1P82279 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRB1P82279 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRB1P82279 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRB1P82279 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRB1P82279 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRB1P82279 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRB1P82279 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CRB1P82279 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRB1P82279 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRB1P82279 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRB1P82279 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRB1P82279 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRB1P82279 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRB1P82279 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CRB1P82279 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRB1P82279 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRB1P82279 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRB1P82279 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRB1P82279 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRB1P82279 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRB1P82279 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRB1P82279 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRB1P82279 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRB1P82279 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRB1P82279 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRB1P82279 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRB1P82279 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms