Protein–RNA interactions for Protein: P80723

BASP1, Brain acid soluble protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BASP1P80723 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BASP1P80723 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BASP1P80723 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BASP1P80723 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BASP1P80723 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BASP1P80723 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BASP1P80723 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BASP1P80723 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BASP1P80723 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BASP1P80723 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BASP1P80723 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BASP1P80723 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BASP1P80723 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BASP1P80723 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BASP1P80723 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BASP1P80723 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BASP1P80723 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BASP1P80723 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BASP1P80723 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BASP1P80723 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BASP1P80723 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BASP1P80723 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BASP1P80723 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BASP1P80723 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BASP1P80723 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BASP1P80723 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BASP1P80723 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BASP1P80723 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms