Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX4P78413 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX4P78413 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX4P78413 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX4P78413 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX4P78413 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX4P78413 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX4P78413 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX4P78413 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX4P78413 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX4P78413 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRX4P78413 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRX4P78413 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms