Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNA1P78396 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNA1P78396 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA1P78396 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms