Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR2FP61218 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2FP61218 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms