Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM258P61165 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TMEM258P61165 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TMEM258P61165 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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