Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP54P61011 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP54P61011 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP54P61011 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRP54P61011 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP54P61011 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP54P61011 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP54P61011 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP54P61011 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP54P61011 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP54P61011 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP54P61011 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP54P61011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRP54P61011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRP54P61011 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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