Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YBEYP58557 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YBEYP58557 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YBEYP58557 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YBEYP58557 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YBEYP58557 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YBEYP58557 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YBEYP58557 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YBEYP58557 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms