Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARL4CP56559 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms