Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH4P55283 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH4P55283 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH4P55283 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH4P55283 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH4P55283 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH4P55283 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH4P55283 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH4P55283 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH4P55283 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH4P55283 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH4P55283 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH4P55283 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH4P55283 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH4P55283 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH4P55283 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH4P55283 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH4P55283 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH4P55283 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH4P55283 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms