Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRPF1P55201 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRPF1P55201 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRPF1P55201 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms