Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATN1P54259 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATN1P54259 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATN1P54259 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATN1P54259 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATN1P54259 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATN1P54259 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATN1P54259 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATN1P54259 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATN1P54259 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATN1P54259 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATN1P54259 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATN1P54259 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATN1P54259 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATN1P54259 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATN1P54259 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATN1P54259 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATN1P54259 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATN1P54259 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATN1P54259 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATN1P54259 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATN1P54259 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATN1P54259 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms