Protein–RNA interactions for Protein: P53047

RTA1, Protein RTA1, yeastyeast

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTA1P53047 BCH2YKR027W 2298 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 MET17YLR303W 1335 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 AEP3YPL005W 1821 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 IRC22YEL001C 678 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 THP2YHR167W 786 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 PRM10YJL108C 1152 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YAE1YJR067C 426 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YRA2YKL214C 612 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 NDL1YLR254C 570 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 ATP14YLR295C 375 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 VMA6YLR447C 1038 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 PRE7YBL041W 726 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YOR366WYOR366W 354 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 PPT2YPL148C 522 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YVC1YOR087W 2028 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 GRS1YBR121C 2004 nt5□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YND1YER005W 1893 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YDR220CYDR220C 294 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 FAU1YER183C 636 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 TYW3YGL050W 822 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 ERG3YLR056W 1098 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YCL007CYCL007C 393 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 SIP1YDR422C 2448 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 MMT2YPL224C 1455 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 PDR10YOR328W 4695 nt4.99□□□□□ -1.61
RTA1P53047 SRS2YJL092W 3525 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YDR274CYDR274C 372 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 ATP6Q0085 780 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YEL067CYEL067C 588 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 RGI1YER067W 486 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 GTF1YGR102C 552 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 REE1YJL217W 597 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 BUD14YAR014C 2130 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 MOH1YBL049W 417 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 HSH49YOR319W 642 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 MFM1YPL060W 1242 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YBR053CYBR053C 1077 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 MRPL27YBR282W 441 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YCL012CYCL012C 405 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YGL176CYGL176C 1665 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 NOC4YPR144C 1659 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 SWC3YAL011W 1878 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 ELP2YGR200C 2367 nt4.98□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YMR102CYMR102C 2505 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 BUD6YLR319C 2367 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 LHP1YDL051W 828 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 BSC2YDR275W 708 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 AUA1YFL010W-A 285 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 GLG2YJL137C 1143 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 BNA1YJR025C 534 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 MED11YMR112C 396 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 NIS1YNL078W 1224 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 PPG1YNR032W 1107 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 YNR071CYNR071C 1029 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 DCS2YOR173W 1062 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 CAF20YOR276W 486 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 CYK3YDL117W 2658 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 PAL1YDR348C 1500 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 CDC6YJL194W 1542 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 VPS38YLR360W 1320 nt4.97□□□□□ -1.61
RTA1P53047 THI7YLR237W 1797 nt4.96□□□□□ -1.61
RTA1P53047 DHR2YKL078W 2208 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 NNK1YKL171W 2787 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YOS1YER074W-A 258 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YER187WYER187W 426 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YGR115CYGR115C 780 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 FIG1YBR040W 897 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 CIN2YPL241C 807 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 GLN4YOR168W 2430 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YOR365CYOR365C 2112 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 STE20YHL007C 2820 nt4.96□□□□□ -1.62
RTA1P53047 ORC4YPR162C 1590 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 RPC11YDR045C 333 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 RAV2YDR202C 1056 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 MDG1YNL173C 1101 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 RRP36YOR287C 903 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YPL062WYPL062W 405 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 NHP6AYPR052C 282 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 MRPL51YPR100W 423 nt4.95□□□□□ -1.62
RTA1P53047 PRS5YOL061W 1491 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YDL027CYDL027C 1263 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 IZH1YDR492W 951 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 CKA1YIL035C 1119 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YJR128WYJR128W 360 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YAR030CYAR030C 342 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 HTA2YBL003C 399 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 ELA1YNL230C 1140 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 SPR2YOR214C 711 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 MUD1YBR119W 897 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 PXA1YPL147W 2613 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 DSL1YNL258C 2265 nt4.94□□□□□ -1.62
RTA1P53047 AVT1YJR001W 1809 nt4.93□□□□□ -1.62
RTA1P53047 WBP1YEL002C 1293 nt4.93□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YGL109WYGL109W 324 nt4.93□□□□□ -1.62
RTA1P53047 CUE3YGL110C 1875 nt4.93□□□□□ -1.62
RTA1P53047 YGR026WYGR026W 837 nt4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms