Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LBX1P52954 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LBX1P52954 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LBX1P52954 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LBX1P52954 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LBX1P52954 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX1P52954 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX1P52954 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX1P52954 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX1P52954 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LBX1P52954 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LBX1P52954 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LBX1P52954 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LBX1P52954 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX1P52954 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX1P52954 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX1P52954 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX1P52954 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX1P52954 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX1P52954 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LBX1P52954 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms