Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRIP2P52943 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP2P52943 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP2P52943 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRIP2P52943 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP2P52943 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms