Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST2P52849 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST2P52849 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST2P52849 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST2P52849 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST2P52849 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST2P52849 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST2P52849 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST2P52849 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST2P52849 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST2P52849 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST2P52849 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST2P52849 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST2P52849 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST2P52849 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST2P52849 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST2P52849 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST2P52849 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST2P52849 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST2P52849 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST2P52849 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST2P52849 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST2P52849 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST2P52849 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST2P52849 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST2P52849 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDST2P52849 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms