Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2A2P52657 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2A2P52657 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2A2P52657 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms