Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAMP50895 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAMP50895 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAMP50895 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAMP50895 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAMP50895 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAMP50895 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCAMP50895 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCAMP50895 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCAMP50895 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCAMP50895 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCAMP50895 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCAMP50895 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BCAMP50895 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAMP50895 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAMP50895 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAMP50895 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAMP50895 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAMP50895 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAMP50895 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAMP50895 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAMP50895 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAMP50895 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAMP50895 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAMP50895 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCAMP50895 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCAMP50895 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCAMP50895 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCAMP50895 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BCAMP50895 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BCAMP50895 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAMP50895 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAMP50895 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAMP50895 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAMP50895 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCAMP50895 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCAMP50895 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAMP50895 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAMP50895 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCAMP50895 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms