Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK7P50613 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK7P50613 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK7P50613 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK7P50613 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK7P50613 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK7P50613 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK7P50613 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK7P50613 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK7P50613 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK7P50613 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK7P50613 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK7P50613 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK7P50613 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK7P50613 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK7P50613 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK7P50613 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK7P50613 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK7P50613 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK7P50613 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK7P50613 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK7P50613 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK7P50613 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK7P50613 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK7P50613 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms