Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIG4P49917 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIG4P49917 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIG4P49917 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIG4P49917 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIG4P49917 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIG4P49917 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIG4P49917 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIG4P49917 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LIG4P49917 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIG4P49917 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIG4P49917 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIG4P49917 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIG4P49917 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIG4P49917 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIG4P49917 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIG4P49917 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LIG4P49917 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIG4P49917 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG4P49917 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG4P49917 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG4P49917 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIG4P49917 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIG4P49917 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIG4P49917 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms