Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSC2P49815 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC2P49815 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC2P49815 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC2P49815 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC2P49815 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSC2P49815 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TSC2P49815 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC2P49815 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC2P49815 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC2P49815 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC2P49815 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC2P49815 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC2P49815 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC2P49815 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSC2P49815 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TSC2P49815 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC2P49815 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC2P49815 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC2P49815 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC2P49815 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC2P49815 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSC2P49815 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSC2P49815 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC2P49815 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC2P49815 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC2P49815 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC2P49815 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC2P49815 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC2P49815 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC2P49815 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSC2P49815 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSC2P49815 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSC2P49815 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSC2P49815 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms