Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA1P49639 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA1P49639 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms