Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALDH9A1P49189 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALDH9A1P49189 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms