Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIP4K2AP48426 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIP4K2AP48426 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms