Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME1P48163 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME1P48163 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME1P48163 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME1P48163 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME1P48163 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME1P48163 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME1P48163 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ME1P48163 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME1P48163 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME1P48163 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME1P48163 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME1P48163 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME1P48163 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME1P48163 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME1P48163 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ME1P48163 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ME1P48163 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ME1P48163 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ME1P48163 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ME1P48163 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME1P48163 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME1P48163 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME1P48163 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ME1P48163 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME1P48163 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME1P48163 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME1P48163 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ME1P48163 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME1P48163 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME1P48163 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME1P48163 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ME1P48163 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ME1P48163 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME1P48163 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME1P48163 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms