Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RANGAP1P46060 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RANGAP1P46060 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RANGAP1P46060 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms