Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCAMP43121 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MCAMP43121 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCAMP43121 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCAMP43121 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCAMP43121 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCAMP43121 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCAMP43121 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCAMP43121 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCAMP43121 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCAMP43121 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCAMP43121 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCAMP43121 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCAMP43121 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCAMP43121 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCAMP43121 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCAMP43121 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCAMP43121 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCAMP43121 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCAMP43121 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCAMP43121 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCAMP43121 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCAMP43121 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCAMP43121 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCAMP43121 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCAMP43121 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCAMP43121 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCAMP43121 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCAMP43121 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MCAMP43121 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCAMP43121 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCAMP43121 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCAMP43121 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCAMP43121 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCAMP43121 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms