Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF5P43026 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF5P43026 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF5P43026 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDF5P43026 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDF5P43026 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDF5P43026 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF5P43026 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF5P43026 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF5P43026 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF5P43026 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF5P43026 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF5P43026 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF5P43026 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GDF5P43026 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms