Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX3P40426 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX3P40426 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX3P40426 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX3P40426 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX3P40426 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX3P40426 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PBX3P40426 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PBX3P40426 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PBX3P40426 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PBX3P40426 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PBX3P40426 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX3P40426 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX3P40426 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX3P40426 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX3P40426 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PBX3P40426 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PBX3P40426 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PBX3P40426 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PBX3P40426 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PBX3P40426 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX3P40426 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX3P40426 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX3P40426 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX3P40426 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX3P40426 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX3P40426 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX3P40426 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PBX3P40426 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX3P40426 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX3P40426 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX3P40426 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PBX3P40426 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms