Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK1P39086 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GRIK1P39086 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms