Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNCAP37840 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNCAP37840 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNCAP37840 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNCAP37840 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNCAP37840 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNCAP37840 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNCAP37840 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms