Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNN1AP37088 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1AP37088 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms