Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP214P35658 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP214P35658 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP214P35658 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUP214P35658 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP214P35658 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP214P35658 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP214P35658 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP214P35658 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP214P35658 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP214P35658 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP214P35658 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP214P35658 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP214P35658 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP214P35658 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP214P35658 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP214P35658 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP214P35658 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP214P35658 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP214P35658 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP214P35658 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP214P35658 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP214P35658 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP214P35658 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP214P35658 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms