Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDIT3P35638 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms