Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTNNA1P35221 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNA1P35221 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms