Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GPC1P35052 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GPC1P35052 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GPC1P35052 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPC1P35052 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC1P35052 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC1P35052 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms