Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HOXA10P31260 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA10P31260 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms