Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF1P30408 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF1P30408 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF1P30408 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF1P30408 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TM4SF1P30408 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM4SF1P30408 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF1P30408 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF1P30408 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF1P30408 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF1P30408 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF1P30408 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF1P30408 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF1P30408 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF1P30408 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF1P30408 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF1P30408 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF1P30408 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF1P30408 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF1P30408 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF1P30408 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM4SF1P30408 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF1P30408 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF1P30408 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF1P30408 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF1P30408 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF1P30408 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF1P30408 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF1P30408 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TM4SF1P30408 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TM4SF1P30408 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms