Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5DP30049 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5DP30049 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms