Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB2P29033 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB2P29033 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB2P29033 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB2P29033 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB2P29033 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB2P29033 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB2P29033 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB2P29033 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB2P29033 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB2P29033 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB2P29033 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB2P29033 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB2P29033 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB2P29033 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB2P29033 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB2P29033 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB2P29033 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB2P29033 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB2P29033 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms