Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYBB3P26998 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms