Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL3RAP26951 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IL3RAP26951 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms