Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD27P26842 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD27P26842 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD27P26842 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD27P26842 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD27P26842 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD27P26842 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD27P26842 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD27P26842 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD27P26842 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD27P26842 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD27P26842 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD27P26842 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD27P26842 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD27P26842 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD27P26842 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD27P26842 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD27P26842 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD27P26842 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD27P26842 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD27P26842 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms