Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMLP26374 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMLP26374 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMLP26374 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMLP26374 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMLP26374 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMLP26374 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMLP26374 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMLP26374 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMLP26374 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMLP26374 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMLP26374 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHMLP26374 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHMLP26374 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHMLP26374 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHMLP26374 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHMLP26374 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMLP26374 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMLP26374 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMLP26374 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMLP26374 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms