Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA1P25391 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms