Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM1P23921 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM1P23921 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM1P23921 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM1P23921 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM1P23921 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM1P23921 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRM1P23921 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRM1P23921 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRM1P23921 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRM1P23921 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM1P23921 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM1P23921 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM1P23921 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM1P23921 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM1P23921 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM1P23921 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM1P23921 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRM1P23921 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM1P23921 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM1P23921 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM1P23921 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM1P23921 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM1P23921 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM1P23921 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRM1P23921 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRM1P23921 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRM1P23921 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRM1P23921 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms