Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HRCP23327 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HRCP23327 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HRCP23327 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HRCP23327 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HRCP23327 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HRCP23327 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HRCP23327 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HRCP23327 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HRCP23327 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HRCP23327 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HRCP23327 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HRCP23327 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HRCP23327 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HRCP23327 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HRCP23327 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HRCP23327 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HRCP23327 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HRCP23327 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HRCP23327 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
HRCP23327 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
HRCP23327 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HRCP23327 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
HRCP23327 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HRCP23327 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HRCP23327 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HRCP23327 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
HRCP23327 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
HRCP23327 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HRCP23327 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HRCP23327 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.81■■■■□ 3
HRCP23327 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.81■■■■□ 3
HRCP23327 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HRCP23327 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HRCP23327 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HRCP23327 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HRCP23327 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HRCP23327 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HRCP23327 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HRCP23327 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HRCP23327 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HRCP23327 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
HRCP23327 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
HRCP23327 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
HRCP23327 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
HRCP23327 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
HRCP23327 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
HRCP23327 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HRCP23327 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HRCP23327 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HRCP23327 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HRCP23327 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HRCP23327 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
HRCP23327 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HRCP23327 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms