Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XPAP23025 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XPAP23025 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XPAP23025 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
XPAP23025 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XPAP23025 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XPAP23025 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPAP23025 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPAP23025 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms